Para o retorno às aulas presenciais, em outubro de 2020, com maior segurança, o Colégio Farroupilha redesenhou alguns processos e preparou uma série de orientações para educadores, estudantes e famílias sobre as medidas e os procedimentos adotados pela instituição. O plano de contingência atualizado frequentemente, inclusive para o início do ano letivo de 2021, tem como base o direcionamento dos órgãos de saúde nacionais e internacionais, as orientações recebidas ao longo da consultoria prestada pelo Hospital Moinhos de Vento e as diretrizes dos protocolos divulgados pelos Poderes Executivos Municipal e Estadual.